由于肉鸡呼吸道病是一类病因多且复杂，病情易反复的疾病，应采取预防为主，治疗为辅，防治结合，早发现、早治疗为原则的综合性防治措施，具体的综合防控方案如下。
1构建并执行生物安全体系
严格落实空栏期鸡舍内外的清扫、冲洗、消毒工作，阻断上批肉鸡遗留下来的各种被病原微生物污染的污物、设备、用具。
重视肉鸡日常带鸡消毒、水线冲洗、消毒工作；
饲养员进入鸡舍必须穿工作服和舍内工作鞋，避免将外来病原带入鸡舍；
严禁外来人员和饲养员窜舍，尤其是邻近鸡舍发病时，应严格封锁，必须每日消毒；
鸡舍远离粪便堆积发酵处理场，病死鸡要深埋；
尽可能杜绝飞禽、老鼠、犬等传染病的携带者。
2加强饲养管理，消除发病诱因
天气变化，昼夜温差较大时，做好防寒保暖工作，减少冷应激；
鸡舍内温度、湿度和光照相对稳定，防止忽高忽低；
饲料、饮水充足卫生；
不喂发霉变质的饲料；
处理好通风换气与扩栏之间的正确关系；
提高饲料营养水平，养护好肠道，提高饲料利用率，减少氨气（NH3）、硫化氢（H2S）等有毒有害气体的产生；
避免免疫抑制病，提高肉鸡抗病抗应激能力。
3做好疫苗接种工作
根据当地实际，制订科学的免疫程序，并进行抗体监测，依据监测结果，进行科学免疫；
严格执行科学合理的免疫程序，提高抗体水平；
注意免疫前后药物的使用，避免影响疫苗免疫效果；
适当添加抗应激药物，减少免疫应激。
4做好预防保健工作
根据肉鸡生长规律，在易发生呼吸道病的时段，做好药物保健；
在天气骤变、疫苗接种后等严重应激容易诱发呼吸道之前，做好做好药物保健。