随着石斑鱼人工繁殖和养殖技术的突破，石斑鱼养殖规模不断扩大，特别是工厂化循环水养殖模式近年来更是成为北方石斑鱼养殖业发展的重要支撑，但是石斑鱼病害的规模化暴发也成为严重阻碍石斑鱼工厂化养殖发展的重大障碍。目前较为有效的降低工厂化石斑鱼病害暴发的措施就是从受精卵消毒、切断病毒的传播途径、养殖水环境监控、养殖管理、日常操作等几个方面全面加强对于神经坏死病毒、寄生虫和细菌的防控。除此之外，尚无有效的药物和其他手段能够从根本上治愈病毒性神经坏死症。
当前在石斑鱼工厂化养殖中出现的病害暴发的现象其实在畜禽养殖业中也普遍存在，不仅造成了巨大的经济损失甚至威胁到人类的生命安全。与畜禽病害的持续斗争已经使人们认识到如果动物健康生存环境得不到基本保障，过高密度饲养，动物活动受限，环境变得极其恶劣，都将造成动物机体抵抗力下降，为疫病的流行和传播创造条件。因此，顺应现代畜禽养殖业的发展，动物福利的概念应运而生，动物福利直译自animal welfare一词，产生于20世纪60年代初，是针对集约化生产中出现的如疾病增多、机体损伤加剧、死亡率上升、异常行为增多等问题而提出的，旨在呼吁保证畜禽正常生产的同时应充分重视畜禽的福利状况，提高畜禽生产过程中的福利水平。为了定义理想的动物福利状态，世界养殖动物福利协会（FAWC）建立了五个免于（自由）的标准框架，分别为：免于饥饿和口渴，免于不适，免于痛苦、伤害和疾病，免于恐惧和悲伤，以及自由表达正常的行为。关注鱼类福利状态鱼类属于水产动物中相对高等的脊椎动物，已有研究证明其对外部不适环境具有感知、应对和记忆的能力，但是由于科学界对于鱼类及其它水产养殖动物是否有能力体验到疼痛、恐惧和悲伤方面还存在一定的争议，因此目前对于水产养殖动物福利评价还主要集中在养殖动物生理健康指标上。就养殖鱼类而言，表观特征、生长状况、死亡率、健康状态、应激反应、行为等通用的鱼类生物学特征均可反映鱼类的福利状态。相关研究已经证实，养殖鱼类福利在受到环境、生物等胁迫压力影响时，鱼体的生理性反应会经历三级阶段。一级阶段：是嗜铬组织释放儿茶酚胺以及下丘脑-垂体-肾间组织轴( HPI) 被激活，刺激其分泌类固醇皮质激素并释放入血液循环系统。二级阶段：是由一级阶段中产生的各种激素所介导的生理和生化水平上的一系列变化，涉及呼吸、代谢、酸碱和渗透压平衡、免疫活性和细胞反应等几乎所有与鱼类生命活动相关的生理功能调节。三级阶段：是在二级阶段的生理、生化变化的基础上，养殖鱼类由于无法适应环境或其他压力所导致的生长缓慢、抗病能力下降、繁殖力差、行动力低甚至形态特征发生变化。近年来，欧洲和美国的科学家对虹鳟、鲷科、鲆鲽类等鱼类的养殖福利进行了探索性的研究，发现不同水交换率、不同放养密度、不同臭氧浓度等养殖条件对养殖鱼类的表观性状（主要是体表和鱼鳍损伤）、畸形率、死亡率、行为特征（主要是游泳、摄食、竞争等）、血液指标（主要是皮质醇和免疫力因子）、神经内分泌（主要是生长激素、神经递质等）均有所影响，于是研究学者和养殖业界逐渐将这些相关指标用于衡量鱼类福利水平。患病的老虎斑在鱼类养殖业中，目前普遍认为能够影响动物福利的环节包括环境因素如设施设备、养殖水体和生物因素如日常操作管理、捕捞运输、饵料供给等。因此，如何从环境、生物的源头上避免由于长期、反复胁迫压力带来的不良的后果就成为了鱼类养殖福利追求的中心目标，具体表现在人为为养殖鱼类提供一个基本符合其生物习性和减少胁迫的养殖环境，保障充足的营养饲料，以及在病害防治、养殖管理、捕捞、运输和加工等过程中采取有利于鱼类自身福利的措施，以达到为社会提供优质、安全的水产品的目的。提升福利养殖水平近年来，石斑鱼工厂化养殖中出现了病害爆发、鱼苗残食严重、苗种畸形率高、苗种发育缓慢、商品鱼体色异常等严重阻碍产业健康发展的现象，其根源与养殖密度过大、营养缺乏、水质恶化和操作不当等引起的养殖鱼的免疫力降低、行为异常、胁迫刺激等关系石斑鱼动物福利水平的因素密切相关。养殖水环境中的氨氮、pH、溶氧、温度、盐度、流速、流态等条件的改变（恶化）所导致的石斑鱼福利水平下降往往会表现为石斑鱼运动能力减弱、体表特征残缺、体色黯淡、生长缓慢、摄食不积极、成活率降低等。应激后的石斑鱼发生胀气现象浮在水面近几年，一批石斑鱼工厂化养殖成功的企业已经开始认识到为石斑鱼提供稳定的养殖水环境的重要性，纷纷通过在石斑鱼工厂化养殖车间中引入循环水设备、水质监控设备、物联网等新兴技术和设施设备来保障适宜的生长环境，并取得了很好的应用效果。养殖管理中的养殖密度也是一个关系到石斑鱼动物福利的重要因素，养殖密度过高将影响石斑鱼的正常生长，增加残食发生的几率以及病害暴发和生产操作的风险；而养殖密度过低，既降低了资源利用率也不利于石斑鱼群体行为的形成。只有适当的养殖密度才能减少石斑鱼由于身体接触造成的伤害，降低采食时的相互干扰和争抢的几率并且减少病毒、细菌和寄生虫等疾病的传播机会。除此之外，日常操作中如分苗、分池、投喂中的人为惊扰应激和操作方式等也会降低石斑鱼福利水平，导致苗种免疫力下降、发育畸形、体色异常甚至大批致死的现象，要改变这种状况必须提高从业人员技能和素质、灌输善待养殖对象的福利养殖理念并制定和严格执行合理的养殖规程。不适的捕捞、运输和加工的操作方式、方法以及保障条件等也会影响石斑鱼的体表特征、体色、肉质乃至存活率等动物福利状况，在石斑鱼养殖业下游中如何根据国内消费者的消费习惯采取有利于提高养殖鱼类福利和产品质量的措施和技术手段，以实现为消费者提供优质、安全的蛋白质的目标将是今后石斑鱼养殖业迈向高端的重要标志。总而言之，目前我国石斑鱼养殖正在由粗放型小作坊式的养殖模式向集约化工业式养殖模式转变，无论从设施装备方面，还是从水质监控、养殖管理、饲料与营养、操作规范等方面都具备了实施福利养殖的条件，许多在粗放和半粗放养殖条件下，由于动物福利水平降低所造成的诸如烂鳍、咬伤、体色异常、生长缓慢、发育畸形和胀鳔等影响养殖石斑鱼产量和品质的问题，通过养殖模式的升级也具备了解决的办法和途径。今后如何在石斑鱼工厂化养殖中提升福利养殖的水平还有许多关键技术问题需要解决，涉及到鱼类生物学、鱼类养殖学、环境生态、系统工程和信息技术等诸多领域，相信在产、学、研各界人士的共同努力下，一个能够保障动物福利以及产品品质的健康可持续发展的石斑鱼养殖业在不久的未来终将实现。